Kuningatar Chrysalis on vaihdokkaiden kuningatar. Hän siis pystyy muuttumaan keneksi tahansa. Hän olikin muuttunut Prinsessa Cadencenseksi jaksossa Häät Canterlotissa osa 1. Chrysalis haluaa hallita koko Equestriaa. Chrysalis oli ovelasti lumonnut Shining Armorin, jottei häntä olisi voinut pysäyttää ja taikonut Cadencen Canterlotin alla oleviin tunneleihin. Myöhemmin Chrysalis taikoi myös Twilight Sparklen sinne. Kuitenkin tämä suunnitelma epäonnistui kaikesta huolimatta jaksossa Häät Canterlotissa osa 2 ja todellisia häitä päästiin viettämään.
Näiden kahden jakson jälkeen häntä ei ole näkynyt uudestaan sarjassa eli hän on vain kakkoskauden pahis. Fluffe Puff-videoissa Chrysalis hengailee Fluffe Puffin kanssa.